Les complications de l'hémodialyse font qu'une dialyse adéquate n'est malheureusement pas toujours obtenue : on note une mortalité annuelle moyenne, tous ages confondus, d'environ 5%.
Il peut s'agir de complications aigues : entre chaque dialyse le patient, dont la fonction rénale est nulle, est exposé à la réappatition rapide de troubles hydro-électrolytiques, essentiellement hyperkaliémie et surcharge liquidienne, la péricardite aigue étant le témoin d'une dialyse inadéquate.
Il s'agit surtout de complications au long cours, car l'insuffisance rénale chronique retentit sur pratiquement tous les organes et tissus. Si l'hémodialyse est capable de corriger rapidement les troubles qui risquent de mettre en jeu la vie du malade, le traitement, prolongé sur des années, ne peut pas toujours contrôler totalement les différentes manifestations dues à la perte des fonctions rénale, d'autant que certaines complications induites par la technique de circulation extracorporelle vont se surajouter à celles de l'insuffisance rénale proprement dite. Ces complications possibles sont nombreuses, de mécanismes souvent complexes : complications osseuses, cardio-vasculaires, hématologiques, infectieuses, diverses (neurologiques,dermatologiques, métaboliques, maladie kystique des reins).